A incubadora MIDI Tecnológico somou diversas conquistas em 2009. No dia 09 de março, a incubadora realizou a cerimônia de graduação de sete empresas: Anima Acústica, AQX, Arvus, Autocorp, JExperts, Labbo e Palmsoft. As empresas foram incubadas entre os anos de 2004 e 2009. Também em março, foi apresentada na Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) uma metodologia multicritérios para a auto-avaliação das ações e dos impactos que o MIDI Tecnológico gera nas empresas que atende.
Em maio, o MIDI realizou mais uma edição do Seed Forum Progressus No evento as empresas se apresentaram para investidores em busca de recursos para ampliarem sua competitividade. Com o objetivo de apoiar cada vez mais empresas nascentes de base tecnológica, a incubadora criou em 2009 um modelo de incubação virtual. A proposta é ampliar o atendimento da incubadora além dos limites do seu espaço físico.
Em 2009, a incubadora cresceu significativamente e recebeu sete novas empresas: ATTA, OBIZ, Netprecision, Chipus, Clean Life, i8 e Tecnoamb. O MIDI Tecnológico também conquistou autorização do Ministério da Ciência e Tecnologia (MCT) para receber incentivos previstos na Lei de Informática. Dessa forma, as incubadas no MIDI poderão ser contratadas por empresas beneficiárias da Lei para a realização de projetos de pesquisa e desenvolvimento.
O MIDI Tecnológico também integrou a Missão Técnica da ANPROTEC, formada por dirigentes de parques tecnológicos, aos Estados Unidos. A incubadora participu do XIX Seminário Nacional de Parques Tecnológicos e Incubadoras de Empresas e do 3º infoDev Fórum Global de Inovação e Empreendedorismo e recebeu visitas técnicas dos participantes dos eventos.
